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Genomics and Bioinformatics
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Quiz Giorno 2

Risposte
1. Che cosa è la bioinformatica?
- a) Lo studio delle piante.
- b) La scienza della vita e degli organismi viventi.
- c) L'applicazione dell'informatica alla biologia e alla medicina.
- d) Una branca della matematica.
2. Qual è lo scopo principale di un database di sequenze?
- a) Conservare immagini.
- b) Memorizzare e recuperare sequenze di DNA, RNA e proteine.
- c) Analizzare dati statistici.
- d) Effettuare operazioni aritmetiche.
3. In quale database è possibile trovare informazioni sulle sequenze di proteine?
- a) Google Scholar.
- b) Microsoft Excel.
- c) SWISS-PROT.
- d) Wikipedia.
4. Cosa fa l'algoritmo BLAST?
- a) Elimina virus informatici.
- b) Crea diagrammi e grafici.
- c) Trova regioni di similitudine tra sequenze biologiche.
- d) Trasforma immagini in codice binario.
5. Che cosa sono i domini di proteine?
- a) Siti web dedicati alle proteine.
- b) Regioni funzionalmente e strutturalmente distinte delle proteine.
- c) Il cibo preferito delle proteine.
- d) Un tipo di RNA.
6. Per cosa sta "FASTA" in bioinformatica?
- a) Un tipo di alimento.
- b) Un metodo per digerire rapidamente.
- c) Un formato di file per sequenze.
- d) Un tipo di software per il disegno.
7. In quale linguaggio di programmazione è scritto l'originale algoritmo BLAST?
- a) Python.
- b) C.
- c) Java.
- d) Ruby.
8. Per quale motivo si esegue l'allineamento di sequenze?
- a) Per giocare a giochi online.
- b) Per trovare somiglianze tra due o più sequenze.
- c) Per riparare il computer.
- d) Per creare una presentazione.
9. Che cosa è un ORF in genomica?
- a) Una sequenza di DNA che può essere tradotta in proteina.
- b) Una sequenza che causa mutazioni.
- c) Un tipo di proteina.
- d) Un sito web.
10. Che cos'è il genoma di riferimento?
- a) Una sequenza standard utilizzata per confronti.
- b) Un tipo di enzima.
- c) Il DNA di una banana.
- d) Una sequenza inventata per film di fantascienza.
11. Che cosa significa annotare una sequenza?
- a) Disegnarla.
- b) Decodificarla.
- c) Assegnare funzioni alle sue regioni.
- d) Cantarla.
12. Per cosa sta "SNP"?
- a) Small Network Protocol.
- b) Synthetic Natural Product.
- c) Single Nucleotide Polymorphism.
- d) Super New Protein.
13. In quale fase del progetto genoma umano sono stati utilizzati gli algoritmi di bioinformatica?
- a) Isolamento del DNA.
- b) Sequenziamento e annotazione.
- c) Estrazione di proteine.
- d) Test sul campo.
14. Che cosa rappresenta il "codice sorgente" in informatica?
- a) Il DNA di un computer.
- b) Una lingua straniera.
- c) Il set di istruzioni scritte per eseguire un programma.
- d) La fonte di alimentazione del computer.
15. Qual è il principale vantaggio dell'uso di Galaxy per i principianti in bioinformatica?
- a) Può funzionare come un videogioco.
- b) Permette analisi complesse senza richiedere competenze di programmazione.
- c) Può essere utilizzato come un editor di testo.
- d) Produce una luce galattica.
16. Che cosa è un file BED in bioinformatica?
- a) Un file che descrive come costruire un letto.
- b) Un file che registra i dati del sonno.
- c) Un formato che contiene informazioni su regioni del genoma.
- d) Un file che contiene immagini di stelle.
17. Che cosa rappresenta un "track" in una visualizzazione del genoma?
- a) Una canzone.
- b) Una corsa.
- c) Una rappresentazione di dati specifici sul genoma.
- d) Una traccia di animali.
18. In quale formato di file è più probabile trovare informazioni sulle varianti genomiche?
- a) PDF.
- b) MP3.
- c) VCF.
- d) JPG.
19. Qual è lo scopo principale di un "genome browser"?
- a) Navigare su Internet.
- b) Visualizzare e analizzare dati genomici.
- c) Giocare a videogiochi.
- d) Comprare prodotti online.
20. Quale di questi non è uno strumento tipico di bioinformatica?
- a) Algoritmi di allineamento.
- b) Genome browsers.
- c) Programmi di disegno grafico.
- d) Software di analisi di espressione genica.
21. Per quale motivo è utile utilizzare un database di sequenze come NCBI?
- a) Per guardare film.
- b) Per giocare a videogiochi online.
- c) Per trovare sequenze di DNA e proteine di diversi organismi.
- d) Per scrivere lettere.
22. Quale di questi non è un formato di file comunemente utilizzato in bioinformatica?
- a) TXT.
- b) FASTQ.
- c) BED.
- d) MP4.
23. Che cosa rappresenta un "read" nel contesto del sequenziamento?
- a) Una storia breve.
- b) Una sequenza ottenuta dal sequenziatore.
- c) Una pausa durante l'esperimento.
- d) Una lista di letture consigliate.
24. Che tipo di informazioni può essere ottenuto da un esperimento di RNA-seq?
- a) Il colore dei capelli dell'individuo.
- b) Il livello di espressione genica in determinate condizioni.
- c) Il numero di cellulari posseduti da un individuo.
- d) Il tipo di cibo preferito da un organismo.
25. In che modo l'algoritmo Smith-Waterman differisce dall'algoritmo BLAST?
- a) È utilizzato per la costruzione di edifici.
- b) È specificamente ottimizzato per brevi sequenze.
- c) Realizza allineamenti locali ottimali.
- d) È un algoritmo di ricerca web.
26. Che cosa rappresenta un exon?
- a) Un organo del corpo.
- b) Un tipo di virus.
- c) Una regione codificante di un gene.
- d) Una forma di energia.
27. A cosa serve il formato SAM/BAM in bioinformatica?
- a) Memorizzare musica.
- b) Archiviare immagini.
- c) Memorizzare allineamenti di sequenze.
- d) Creare presentazioni.
28. Perché è importante annotare i genomi?
- a) Per rendere il genoma più attraente.
- b) Per determinare la funzione delle diverse regioni genomiche.
- c) Per cambiare il colore del DNA.
- d) Per rendere il genoma più grande.
29. Cosa si intende per metagenomica?
- a) Lo studio del meta-DNA.
- b) L'arte di manipolare i genomi.
- c) Lo studio dei genomi di comunità microbiche da campioni ambientali.
- d) La ricerca di genomi in altri universi.
30. Quale di questi strumenti non è tipicamente utilizzato per l'analisi di dati di RNA-seq?
- a) Photoshop.
- b) STAR.
- c) HTSeq.
- d) Cufflinks.
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