Giorno 15: Analisi delle Vie Metaboliche e della Regolazione Genica con Galaxy
Obiettivo: Questa sessione si concentrerà sulla comprensione delle vie metaboliche e della regolazione genica, oltre a esplorare come questi processi possono essere analizzati utilizzando la piattaforma Galaxy.
Materiale necessario:
Slide e materiali illustrativi sulle vie metaboliche e la regolazione genica.
Computer con accesso a Internet per ogni studente.
Accesso alla piattaforma Galaxy.
Dataset di esempio riguardanti espressione genica e pathway metabolici.
Suddivisione oraria:
Introduzione alle Vie Metaboliche (30 minuti):
Cosa sono le vie metaboliche e perché sono importanti?
Concetto di metabolita, enzima e reazione.
Esempi principali di pathway e loro rilevanza nella biologia.
Pratica con le Vie Metaboliche su Galaxy (1 ora):
Esercizio guidato: Caricamento di dati metabolici su Galaxy.
Uso di strumenti specifici per visualizzare e analizzare le vie metaboliche.
Interpretazione dei risultati: identificazione dei metaboliti chiave e delle reazioni metaboliche principali.
Pausa (15 minuti)
Introduzione alla Regolazione Genica (30 minuti):
Cos'è la regolazione genica e perché è essenziale?
Concetto di promotore, repressore, enhancer e silencer.
Regolazione a livello trascrizionale, post-trascrizionale e traduzionale.
Analisi della Regolazione Genica con Galaxy (1 ora):
Esercizio guidato: Analisi dell'espressione genica e identificazione di regioni regolatorie utilizzando strumenti Galaxy.
Interpretazione dei risultati: comprensione dei meccanismi di regolazione e delle loro implicazioni funzionali.
Elementi di Gamification (30 minuti):
Gioco/simulazione: Gli studenti provano a "regolare" l'espressione di un gene in un sistema simulato, sperimentando con diversi fattori regolatori.
Discussione e riflessioni sul gioco: comprendere le sfide e le complessità della regolazione genica.
Al termine del Giorno 15, gli studenti avranno una visione chiara delle vie metaboliche e dei meccanismi di regolazione genica, e saranno capaci di utilizzare Galaxy per analizzare dati pertinenti a questi argomenti. Questa sessione fornirà una base solida per esplorare ulteriormente la complessità delle reti biologiche e la loro regolazione.
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