Giorno 15: Analisi delle Vie Metaboliche e della Regolazione Genica con Galaxy
Obiettivo: Questa sessione si concentrerà sulla comprensione delle vie metaboliche e della regolazione genica, oltre a esplorare come questi processi possono essere analizzati utilizzando la piattaforma Galaxy.
Materiale necessario:
Slide e materiali illustrativi sulle vie metaboliche e la regolazione genica. Computer con accesso a Internet per ogni studente. Accesso alla piattaforma Galaxy. Dataset di esempio riguardanti espressione genica e pathway metabolici. Suddivisione oraria:
Introduzione alle Vie Metaboliche (30 minuti): Cosa sono le vie metaboliche e perché sono importanti? Concetto di metabolita, enzima e reazione. Esempi principali di pathway e loro rilevanza nella biologia. Pratica con le Vie Metaboliche su Galaxy (1 ora): Esercizio guidato: Caricamento di dati metabolici su Galaxy. Uso di strumenti specifici per visualizzare e analizzare le vie metaboliche. Interpretazione dei risultati: identificazione dei metaboliti chiave e delle reazioni metaboliche principali. Introduzione alla Regolazione Genica (30 minuti): Cos'è la regolazione genica e perché è essenziale? Concetto di promotore, repressore, enhancer e silencer. Regolazione a livello trascrizionale, post-trascrizionale e traduzionale. Analisi della Regolazione Genica con Galaxy (1 ora): Esercizio guidato: Analisi dell'espressione genica e identificazione di regioni regolatorie utilizzando strumenti Galaxy. Interpretazione dei risultati: comprensione dei meccanismi di regolazione e delle loro implicazioni funzionali. Elementi di Gamification (30 minuti): Gioco/simulazione: Gli studenti provano a "regolare" l'espressione di un gene in un sistema simulato, sperimentando con diversi fattori regolatori. Discussione e riflessioni sul gioco: comprendere le sfide e le complessità della regolazione genica. Al termine del Giorno 15, gli studenti avranno una visione chiara delle vie metaboliche e dei meccanismi di regolazione genica, e saranno capaci di utilizzare Galaxy per analizzare dati pertinenti a questi argomenti. Questa sessione fornirà una base solida per esplorare ulteriormente la complessità delle reti biologiche e la loro regolazione.
