DAY 8

Giorno 8: Interpretazione Funzionale e Introduzione all'Analisi Pathway con Galaxy

Obiettivo: Fornire agli studenti le competenze necessarie per interpretare i risultati dell'analisi differenziale delle espressioni a un livello funzionale e introducirli all'analisi dei pathway.

⁠

Materiale necessario:

Slides sull'interpretazione funzionale dei geni differenzialmente espressi e l'analisi dei pathway.

Computer con accesso a Internet per ogni studente.

Tutorial interattivi o guide step-by-step per l'analisi dei pathway su Galaxy.

Dataset di esempio dal Giorno 7, con elenco dei geni differenzialmente espressi.

⁠

Suddivisione oraria:

Introduzione all'Interpretazione Funzionale (45 minuti):

Cosa significa interpretare funzionalmente i geni differenzialmente espressi?

Panoramica delle risorse di annotazione genica (es. GO, KEGG).

Importanza dell'analisi dell'enrichment.

Pratica con Galaxy: Interpretazione Funzionale (1 ora):

Esercizio guidato: Utilizzo di Galaxy per eseguire un'analisi dell'enrichment sui geni differenzialmente espressi.

Interpretazione delle categorie funzionali o dei pathway arricchiti.

Pausa (15 minuti)

Introduzione all'Analisi dei Pathway (30 minuti):

Cos'è l'analisi dei pathway e come può essere utilizzata per interpretare i dati di espressione genica?

Esempi di pathway chiave e la loro importanza in biologia e medicina.

Pratica con Galaxy: Analisi dei Pathway (1 ora):

Esercizio guidato: Utilizzo di Galaxy per esplorare i pathway associati ai geni differenzialmente espressi.

Interpretazione dei risultati e comprensione delle interazioni geniche.

Elementi di Gamification e Discussione (15 minuti):

Gioco interattivo o sfida sulla mappatura dei geni su un pathway.

Discussione su come l'analisi dei pathway può fornire intuizioni approfondite sulla biologia sottostante.

⁠

Alla fine del Giorno 8, gli studenti avranno una chiara comprensione di come interpretare i risultati dell'analisi differenziale delle espressioni a un livello più profondo e funzionale. Avranno anche una solida introduzione all'analisi dei pathway, fornendo loro ulteriori strumenti per comprendere la biologia sottostante ai loro dati. Il focus può ora spostarsi verso tecniche più avanzate o argomenti correlati in bioinformatica nei giorni successivi.

Want to print your doc?
This is not the way.

Try clicking the ⋯ next to your doc name or using a keyboard shortcut (

CtrlP

) instead.