DAY 16

Giorno 16: Analisi di Associazione del Genoma e Studi di Interazione Proteina-Proteina con Galaxy

Obiettivo: Questa sessione introdurrà gli studenti alle analisi di associazione del genoma (GWAS) e agli studi di interazione proteina-proteina, fornendo una panoramica di come questi approcci possono rivelare informazioni fondamentali sulla funzione genica e sulle relazioni tra proteine.

⁠

Materiale necessario:

Slide e materiali illustrativi sulle GWAS e sull'interazione proteina-proteina.

Computer con accesso a Internet per ogni studente.

Accesso alla piattaforma Galaxy.

Dataset di esempio per GWAS e interazioni proteina-proteina.

⁠

Suddivisione oraria:

Introduzione alle Analisi di Associazione del Genoma (GWAS) (30 minuti):

Cos'è una GWAS e perché è importante?

Principi di base: popolazione di studio, associazione e significato statistico.

Applicazioni e scoperte realizzate tramite GWAS.

Pratica con GWAS su Galaxy (1 ora):

Esercizio guidato: Caricamento di dati genotipici e fenotipici su Galaxy.

Uso di strumenti specifici di Galaxy per eseguire un'analisi GWAS.

Interpretazione dei risultati: identificazione e interpretazione dei punti di associazione.

Pausa (15 minuti)

Introduzione agli Studi di Interazione Proteina-Proteina (30 minuti):

Cos'è l'interazione proteina-proteina e perché è fondamentale?

Metodi per rilevare le interazioni proteina-proteina.

Importanza delle reti di interazione proteina-proteina nella biologia.

Analisi delle Interazioni Proteina-Proteina con Galaxy (1 ora):

Esercizio guidato: Caricamento di dati di interazione proteina-proteina su Galaxy.

Uso di strumenti specifici di Galaxy per visualizzare e analizzare reti di interazione.

Interpretazione dei risultati: identificazione dei nodi chiave e delle relazioni tra proteine.

Elementi di Gamification (30 minuti):

Gioco/simulazione: Gli studenti creano una rete di interazione proteina-proteina simulata e sperimentano la rimozione o l'aggiunta di nodi per comprendere l'importanza di ciascun componente.

Discussione e riflessioni sul gioco: esplorazione delle complessità e delle sfide nell'analizzare le reti proteiche.

⁠

Al termine del Giorno 16, gli studenti avranno una comprensione approfondita delle GWAS e degli studi di interazione proteina-proteina, e saranno in grado di utilizzare Galaxy per analizzare dati relativi a questi argomenti. Questa sessione rappresenta un tassello fondamentale nella comprensione della complessità funzionale e delle interazioni nel genoma e nel proteoma.

Want to print your doc?
This is not the way.

Try clicking the ⋯ next to your doc name or using a keyboard shortcut (

CtrlP

) instead.