Giorno 16: Analisi di Associazione del Genoma e Studi di Interazione Proteina-Proteina con Galaxy
Obiettivo: Questa sessione introdurrà gli studenti alle analisi di associazione del genoma (GWAS) e agli studi di interazione proteina-proteina, fornendo una panoramica di come questi approcci possono rivelare informazioni fondamentali sulla funzione genica e sulle relazioni tra proteine.
Materiale necessario:
Slide e materiali illustrativi sulle GWAS e sull'interazione proteina-proteina. Computer con accesso a Internet per ogni studente. Accesso alla piattaforma Galaxy. Dataset di esempio per GWAS e interazioni proteina-proteina. Suddivisione oraria:
Introduzione alle Analisi di Associazione del Genoma (GWAS) (30 minuti): Cos'è una GWAS e perché è importante? Principi di base: popolazione di studio, associazione e significato statistico. Applicazioni e scoperte realizzate tramite GWAS. Pratica con GWAS su Galaxy (1 ora): Esercizio guidato: Caricamento di dati genotipici e fenotipici su Galaxy. Uso di strumenti specifici di Galaxy per eseguire un'analisi GWAS. Interpretazione dei risultati: identificazione e interpretazione dei punti di associazione. Introduzione agli Studi di Interazione Proteina-Proteina (30 minuti): Cos'è l'interazione proteina-proteina e perché è fondamentale? Metodi per rilevare le interazioni proteina-proteina. Importanza delle reti di interazione proteina-proteina nella biologia. Analisi delle Interazioni Proteina-Proteina con Galaxy (1 ora): Esercizio guidato: Caricamento di dati di interazione proteina-proteina su Galaxy. Uso di strumenti specifici di Galaxy per visualizzare e analizzare reti di interazione. Interpretazione dei risultati: identificazione dei nodi chiave e delle relazioni tra proteine. Elementi di Gamification (30 minuti): Gioco/simulazione: Gli studenti creano una rete di interazione proteina-proteina simulata e sperimentano la rimozione o l'aggiunta di nodi per comprendere l'importanza di ciascun componente. Discussione e riflessioni sul gioco: esplorazione delle complessità e delle sfide nell'analizzare le reti proteiche. Al termine del Giorno 16, gli studenti avranno una comprensione approfondita delle GWAS e degli studi di interazione proteina-proteina, e saranno in grado di utilizzare Galaxy per analizzare dati relativi a questi argomenti. Questa sessione rappresenta un tassello fondamentale nella comprensione della complessità funzionale e delle interazioni nel genoma e nel proteoma.
