Giorno 12: Esplorazione delle Interazioni Proteiche e Rete dei Geni
Obiettivo: Introdotto il concetto di reti in biologia, questo giorno mira a fornire una comprensione delle interazioni proteiche e delle reti geniche, sottolineando come questi concetti sono cruciali per comprendere la complessità dei sistemi biologici.
Materiale necessario:
Slides illustrative sulle interazioni proteiche e reti geniche.
Computer con accesso a Internet per ogni studente.
Tutorial interattivi o guide step-by-step per l'utilizzo di strumenti come STRING o Cytoscape.
Dataset di esempio che mostra interazioni proteiche o geniche.
Suddivisione oraria:
Introduzione alle Interazioni Proteiche (30 minuti):
Che cosa sono e perché sono importanti?
Tipi di interazioni proteiche: temporanee vs. stabili, dirette vs. mediate.
Esempi di come le interazioni proteiche regolano i processi cellulari.
Rete dei Geni: Una panoramica (30 minuti):
Come i geni interagiscono tra loro per formare reti complesse.
Importanza delle reti geniche nella regolazione dell'espressione genica e dei processi cellulari.
Pausa (15 minuti)
Pratica con gli Strumenti di Interazione Proteica (1 ora):
Esercizio guidato: Utilizzo di STRING per esplorare le interazioni proteiche di un determinato gene o proteina.
Interpretazione dei risultati: Che cosa rivelano queste interazioni sulle funzioni di un particolare gene/proteina?
Visualizzazione e Analisi delle Reti con Cytoscape (1 ora):
Tutorial introduttivo: Come importare dati di interazione in Cytoscape e creare una rete visiva.
Analisi di base delle reti: identificazione di nodi/genes chiave, cluster o comunità all'interno della rete.
Elementi di Gamification (30 minuti):
Gioco di associazione: Gli studenti ricevono una serie di proteine e devono dedurre o prevedere possibili interazioni basandosi su ciò che hanno appreso.
Discussione e riflessioni sul gioco.
Con il completamento del Giorno 12, gli studenti avranno una solida base sulle interazioni proteiche e le reti geniche, e saranno equipaggiati con strumenti pratici per esplorare e analizzare questi concetti. Queste competenze sono fondamentali per la ricerca avanzata in bioinformatica e biologia dei sistemi.
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