Giorno 3: Fondamenti di Genomica e Approfondimento su Analisi di Sequenziamento
Obiettivo: Introdurre gli studenti alla genomica, fornire una comprensione chiara delle tecniche di sequenziamento e familiarizzarli con le principali analisi in bioinformatica correlate.
Materiale necessario:
Slides sulla genomica e sulle tecniche di sequenziamento.
Computer con accesso a Internet per ogni studente.
Dataset di esempio di sequenze genetiche per l'analisi pratica.
Tutorial interattivi o guide step-by-step specifiche per le analisi di sequenziamento su Galaxy.
Suddivisione oraria:
Introduzione alla Genomica (45 minuti):
Cosa sono i geni, il genoma, e come funzionano.
Breve storia del sequenziamento del DNA.
Principali applicazioni della genomica nella medicina, ricerca e industria.
Tecniche di Sequenziamento (30 minuti):
Panoramica delle tecniche di sequenziamento: da Sanger al sequenziamento di nuova generazione (NGS).
Vantaggi e sfide delle diverse tecniche.
Pausa (15 minuti)
Analisi di Sequenziamento su Galaxy (45 minuti):
Caricamento dei dati di sequenziamento e preparazione per l'analisi.
Introduzione agli strumenti di analisi di sequenziamento disponibili su Galaxy.
Esempio pratico di un'analisi, come l'allineamento delle sequenze.
Lavoro Pratico: Esercizio di Sequenziamento (45 minuti):
Gli studenti riceveranno un dataset di esempio e seguiranno un tutorial per eseguire una specifica analisi di sequenziamento.
I tutor saranno disponibili per domande e assistenza.
Discussione e Riflessione (30 minuti):
Discussione su come le tecniche di sequenziamento possono essere applicate in vari campi.
Interazione con elementi di gamification: ad esempio, quiz sulla genomica e sull'analisi appena eseguita, con assegnazione di punti o badge.
Il terzo giorno è focalizzato sulla teoria e la pratica della genomica. Dopo una solida introduzione teorica, gli studenti avranno l'opportunità di immergersi in un esercizio pratico su Galaxy, utilizzando strumenti reali di analisi del sequenziamento. Questa combinazione di teoria e pratica dovrebbe aiutare a consolidare la loro comprensione e dare loro la fiducia di esplorare ulteriori analisi da soli nei giorni successivi.
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