Giorno 4: Introduzione alla Bioinformatica e Primer sugli Strumenti di Galaxy
Obiettivo: Familiarizzare gli studenti con i concetti chiave della bioinformatica, mostrare come la bioinformatica sia centrale nella genomica, e presentare loro gli strumenti di base di Galaxy per l'analisi dei dati genomici.
Materiale necessario:
Slides sui principi di base della bioinformatica.
Computer con accesso a Internet per ogni studente.
Tutorial interattivi o guide step-by-step per familiarizzare con Galaxy.
Dataset di esempio per dimostrazioni e esercizi pratici.
Suddivisione oraria:
Introduzione alla Bioinformatica (45 minuti):
Cos'è la bioinformatica e perché è importante.
Breve storia della bioinformatica: dalla proteomica alla genomica.
Principali sfide e problemi risolti dalla bioinformatica.
Pausa (15 minuti)
Galaxy: La Piattaforma e le Sue Potenzialità (45 minuti):
Cosa è Galaxy e perché è uno strumento di riferimento in bioinformatica.
Panoramica dell'interfaccia e delle principali funzionalità di Galaxy.
Caricamento dei dati, formati dei file, e organizzazione del lavoro.
Esercizio Pratico: Iniziare con Galaxy (1 ora e 15 minuti):
Guida step-by-step sull'uso degli strumenti di base di Galaxy.
Analisi di un dataset di esempio: dall'importazione dei dati alla visualizzazione dei risultati.
I tutor saranno disponibili per domande e assistenza.
Elementi di Gamification e Discussione (30 minuti):
Quiz interattivo sulla bioinformatica e Galaxy con assegnazione di punti o badge.
Discussione aperta sugli strumenti bioinformatici e come possono influenzare la ricerca e la medicina.
Nel quarto giorno, l'enfasi è posta sulla bioinformatica come disciplina e su come gli strumenti come Galaxy possano essere utilizzati per analizzare i dati genomici. La combinazione di lezioni teoriche e esercizi pratici è progettata per dare agli studenti una comprensione solida e pratica della materia, preparandoli per analisi più complesse nei giorni successivi.
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