DAY 14

Giorno 14: Analisi della Traduzione e Introduzione alle Proteine con Galaxy

Obiettivo: Durante questa sessione, gli studenti si concentreranno sulla traduzione, la fase successiva del flusso centrale della biologia molecolare. Impareranno come l'informazione genetica viene utilizzata per produrre proteine e come analizzare dati proteici con l'ausilio di Galaxy.

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Materiale necessario:

Slide e materiali illustrativi sulla traduzione e le proteine.

Computer con accesso a Internet per ogni studente.

Accesso alla piattaforma Galaxy.

Dataset di esempio di sequenze proteiche e dati di traduzione.

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Suddivisione oraria:

Introduzione alla Traduzione (30 minuti):

Cos'è la traduzione?

Il ruolo dei ribosomi, tRNA e altri fattori nella traduzione.

Dall'mRNA alle proteine: come funziona?

Pratica con la Traduzione su Galaxy (1 ora):

Esercizio guidato: Caricamento di sequenze di mRNA su Galaxy e simulazione della traduzione per ottenere sequenze proteiche.

Interpretazione dei risultati: identificazione delle sequenze di amminoacidi e comprensione delle proprietà delle proteine risultanti.

Pausa (15 minuti)

Introduzione alle Proteine (30 minuti):

Struttura e funzione delle proteine.

Principali classi di proteine e le loro funzioni biologiche.

Post-traduzione: modifiche e piegamento delle proteine.

Analisi dei Dati Proteici con Galaxy (1 ora):

Esercizio guidato: Analisi delle sequenze proteiche utilizzando strumenti disponibili su Galaxy.

Uso di strumenti per l'analisi delle proprietà delle proteine, come isoelettrico point, struttura secondaria, domini proteici e altro.

Elementi di Gamification (30 minuti):

Gioco/simulazione: Gli studenti "costruiscono" una proteina virtualmente, selezionando amminoacidi e osservando come queste scelte influenzano la struttura e la funzione.

Discussione e riflessioni sul gioco: esplorare come le piccole variazioni nelle sequenze proteiche possono avere grandi impatti sulle funzioni biologiche.

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Al termine del Giorno 14, gli studenti avranno una solida comprensione della traduzione e delle proteine, e saranno in grado di utilizzare Galaxy per analizzare dati proteici. Questa sessione approfondirà ulteriormente le loro competenze nella bioinformatica e nella biologia molecolare.

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