Giorno 14: Analisi della Traduzione e Introduzione alle Proteine con Galaxy
Obiettivo: Durante questa sessione, gli studenti si concentreranno sulla traduzione, la fase successiva del flusso centrale della biologia molecolare. Impareranno come l'informazione genetica viene utilizzata per produrre proteine e come analizzare dati proteici con l'ausilio di Galaxy.
Materiale necessario:
Slide e materiali illustrativi sulla traduzione e le proteine.
Computer con accesso a Internet per ogni studente.
Accesso alla piattaforma Galaxy.
Dataset di esempio di sequenze proteiche e dati di traduzione.
Suddivisione oraria:
Introduzione alla Traduzione (30 minuti):
Cos'è la traduzione?
Il ruolo dei ribosomi, tRNA e altri fattori nella traduzione.
Dall'mRNA alle proteine: come funziona?
Pratica con la Traduzione su Galaxy (1 ora):
Esercizio guidato: Caricamento di sequenze di mRNA su Galaxy e simulazione della traduzione per ottenere sequenze proteiche.
Interpretazione dei risultati: identificazione delle sequenze di amminoacidi e comprensione delle proprietà delle proteine risultanti.
Pausa (15 minuti)
Introduzione alle Proteine (30 minuti):
Struttura e funzione delle proteine.
Principali classi di proteine e le loro funzioni biologiche.
Post-traduzione: modifiche e piegamento delle proteine.
Analisi dei Dati Proteici con Galaxy (1 ora):
Esercizio guidato: Analisi delle sequenze proteiche utilizzando strumenti disponibili su Galaxy.
Uso di strumenti per l'analisi delle proprietà delle proteine, come isoelettrico point, struttura secondaria, domini proteici e altro.
Elementi di Gamification (30 minuti):
Gioco/simulazione: Gli studenti "costruiscono" una proteina virtualmente, selezionando amminoacidi e osservando come queste scelte influenzano la struttura e la funzione.
Discussione e riflessioni sul gioco: esplorare come le piccole variazioni nelle sequenze proteiche possono avere grandi impatti sulle funzioni biologiche.
Al termine del Giorno 14, gli studenti avranno una solida comprensione della traduzione e delle proteine, e saranno in grado di utilizzare Galaxy per analizzare dati proteici. Questa sessione approfondirà ulteriormente le loro competenze nella bioinformatica e nella biologia molecolare.
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