Nejdůležitější m fakt, který má podle o struktuře proteinů padnout, je: Primární struktura (pořadí aminokyselinových zbytků) ovlivňuje všechny další struktury.
Zkusme si to. Vylezeme z lavice a třeba i půjdeme na chodbu. Každý z vás je zbytek nějaké kyseliny. Předem víme, že tady Honza musí být blízko Lenky a taky Tereza se musí dotýkat Anety.
Seraďte se (třeba podle velikosti), chytněte se za ruce a vytvořte řetězec. Dříve zmíněné dvojice se dotknou nohou. Co se stane? Řetězec se nějak zkroutí. Jeho konformaci zakreslete na tabuli nebo vyfoťte.
A teď jen změníme primární strukturu. Výběr aminokyselin bude stejný, jen se změní pořadí. Seraďte se třeba podle abecedy. A znovu, Honza se nohou dotkne Lenky a Tereza Anety.
Co se stalo? Konformace je zcela jiná!
Analogie je asi jasná:
Pevné spojení rukama je amidová (peptidová) vazba.